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Droits

Arrêt maladie longue durée : indemnités, durée et reprise

Arrêt maladie longue durée : calcul des indemnités journalières, durée maximale (1 an ou 3 ans selon l'ALD depuis octobre 2026) et étapes pour reprendre.

7 min de lecture Publié le 4 novembre 2026 La rédaction Carnet Emploi

7 min · 4 nov. 2026 · Carnet Emploi

Un médecin discute avec un patient dans son cabinet
Photo : Unsplash, libre de droit
En bref
IJ = 50 % de ton salaire, 42,97 € brut par jour au maximum
12 mois d'IJ sur 3 ans, ou 3 ans pour une ALD exonérante
1 an maximum pour une ALD non exonérante depuis le 15 octobre 2026
Visite de reprise obligatoire après 60 jours d'arrêt

Pendant un arrêt maladie longue durée, l’Assurance maladie te verse des indemnités journalières (IJ) égales à 50 % de ton salaire journalier de base, dans la limite de 42,97 € brut par jour en 2026. La durée maximale dépend de ta maladie : 12 mois d’IJ sur 3 ans dans le cas général, jusqu’à 3 ans pour une affection de longue durée (ALD) exonérante, et seulement 1 an pour une ALD non exonérante depuis le 15 octobre 2026. Voici comment ça marche, et comment préparer ton retour au travail.

Arrêt maladie longue durée : de quoi parle-t-on ?

« Longue durée » n’est pas un statut officiel. En pratique, on parle d’arrêt long à partir de 6 mois, car c’est à ce moment que les règles changent : conditions plus strictes pour continuer à être indemnisé, contrôle du médecin conseil, durée maximale différente selon ta maladie.

Il faut aussi distinguer deux types d’ALD :

  • L’ALD exonérante : une maladie de la liste des affections qui demandent un traitement long et coûteux (ou une maladie grave reconnue hors liste). Tes soins liés à cette maladie sont pris en charge à 100 %.
  • L’ALD non exonérante : une maladie qui t’oblige à un arrêt de plus de 6 mois, mais dont les soins ne sont pas pris en charge à 100 %.

Ton médecin traitant ou le service médical de ta caisse peut te dire dans quelle catégorie tu es.

Les conditions pour être indemnisé plus de 6 mois

Pour les 6 premiers mois, il suffit en général d’avoir travaillé 150 heures sur les 3 derniers mois. Au-delà de 6 mois d’arrêt, tu dois réunir deux conditions :

  • être affilié à la Sécurité sociale depuis au moins 12 mois à la date de l’arrêt ;
  • avoir travaillé au moins 600 heures sur les 12 mois précédents, ou avoir cotisé sur un salaire d’au moins 2 030 fois le SMIC horaire sur cette période.

Combien vas-tu toucher ?

Le calcul se fait en trois étapes :

  1. On additionne tes 3 derniers salaires bruts, plafonnés à 1,4 SMIC par mois.
  2. On divise par 91,25 pour obtenir ton salaire journalier de base.
  3. L’IJ vaut 50 % de ce montant.

Exemple : Julien gagne 2 000 € brut par mois. Son salaire journalier de base est de 65,75 €, et son IJ de 32,87 € brut par jour. Sur un mois de 30 jours, ça fait environ 986 € brut.

Le plafond donne une IJ maximale de 42,97 € brut par jour en 2026. Les IJ sont versées tous les 14 jours, et tous les jours comptent, week-ends compris. Il y a un délai de carence de 3 jours au début de chaque arrêt, mais pas pour les arrêts successifs liés à une même ALD.

Le complément de ton employeur

Si tu as au moins un an d’ancienneté, ton employeur doit compléter tes IJ : 90 % de ton salaire brut pendant une première période, puis 66,66 % pendant une seconde. La durée dépend de ton ancienneté, de 60 jours au total (entre 1 et 5 ans) jusqu’à 180 jours (31 ans et plus). Ce complément démarre après 7 jours de carence, sauf convention collective plus favorable. Pour un arrêt long, regarde aussi la prévoyance de ton entreprise : elle prend souvent le relais.

Durée maximale : ce qui change au 15 octobre 2026

Ta situation Durée maximale des IJ
Maladie « classique » 12 mois d’IJ (360 jours) sur 3 ans
ALD exonérante 3 ans par arrêt
ALD non exonérante, arrêt prescrit depuis le 15 octobre 2026 1 an
ALD non exonérante, déjà plus de 6 mois d’arrêt au 15 octobre 2026 3 ans (ancienne règle)

C’est le décret n° 2026-866 du 16 septembre 2026 qui a réduit de 3 ans à 1 an l’indemnisation des ALD non exonérantes. La nouvelle règle s’applique aux arrêts prescrits depuis le 15 octobre 2026, et aux arrêts en cours qui atteignent 6 mois après cette date.

Dans les deux cas d’ALD, tu dois avoir repris le travail pendant au moins un an pour ouvrir une nouvelle période d’indemnisation pour la même maladie.

Et si tu ne peux toujours pas reprendre ?

À la fin de tes droits aux IJ, si ton état de santé réduit fortement ta capacité de travail, le médecin conseil peut étudier un passage en invalidité. Parles-en tôt avec ton médecin traitant. Notre outil Mes droits t’aide aussi à repérer les aides possibles si tes revenus baissent.

Préparer la reprise : les rendez-vous à connaître

Un arrêt long se prépare avant la date de retour. Trois rendez-vous existent :

  • Le rendez-vous de liaison : à partir de 30 jours d’arrêt, ton employeur peut te proposer un échange pour parler de ton retour. Tu n’es pas obligé d’accepter.
  • La visite de pré-reprise : possible dès 30 jours d’arrêt. Tu peux la demander toi-même, ou passer par ton médecin traitant, le médecin conseil ou le médecin du travail. Elle sert à anticiper un aménagement de poste, une formation ou un temps partiel.
  • La visite de reprise : obligatoire après un arrêt maladie d’au moins 60 jours. Elle a lieu avec le médecin du travail, dans les 8 jours qui suivent ton retour, et c’est ton employeur qui l’organise.

Pour les arrêts délivrés depuis le 15 juin 2026, la visite de reprise peut être évitée si une visite de pré-reprise a eu lieu dans les 30 jours avant ton retour et que le médecin du travail a conclu qu’aucun aménagement n’était nécessaire.

Questions fréquentes

Combien de temps peut durer un arrêt maladie longue durée ?

Ça dépend de ta maladie : 12 mois d’IJ sur 3 ans dans le cas général, jusqu’à 3 ans pour une ALD exonérante, et 1 an pour une ALD non exonérante si ton arrêt a été prescrit depuis le 15 octobre 2026.

Quel est le montant des indemnités journalières en arrêt longue durée ?

50 % de ton salaire journalier de base, calculé sur tes 3 derniers salaires bruts plafonnés à 1,4 SMIC. En 2026, l’IJ maximale est de 42,97 € brut par jour. Ton employeur et ta prévoyance peuvent compléter.

Qu’est-ce qu’une ALD non exonérante ?

C’est une maladie qui impose un arrêt de plus de 6 mois, mais dont les soins ne sont pas remboursés à 100 %. Depuis le 15 octobre 2026, les nouveaux arrêts dans ce cas sont indemnisés un an au maximum.

La visite de reprise est-elle obligatoire ?

Oui, après un arrêt maladie d’au moins 60 jours. Elle doit avoir lieu dans les 8 jours suivant ton retour. Une dispense existe pour les arrêts délivrés depuis le 15 juin 2026, si une pré-reprise récente a conclu qu’aucun aménagement n’était utile.

Peut-on être licencié pendant un arrêt maladie longue durée ?

La maladie ne peut pas être un motif de licenciement en soi. En revanche, un licenciement reste possible pour d’autres raisons, par exemple si l’absence prolongée perturbe gravement l’entreprise et oblige à te remplacer définitivement. En cas de doute, contacte un défenseur syndical ou l’inspection du travail.

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